De ahí se trasladó hasta el futbol de la MLS en donde fue entrenador del Chicago Fire FC con un total de 149 encuentros y sumó un total de 64 derrotas, más que las victorias y partidos empatados. Se despidió en noviembre del 2019 y fue hasta octubre del 2020 cuando regresó al banquillo en Inglaterra.
Llegó al conjunto del Reading de Inglaterra de la Football League Championship, la segunda división del futbol inglés, disputó un total de 82 encuentros, en donde se despidió después de dejar al equipo en puestos de descenso.
El último partido de Veljko Paunović al mando del Reading fue en la victoria de Preston North End con un resultado de 3-2 cuando nombraron a Paul Ince como su remplazo interino.
Fue su novena victoria en la temporada con el Reading y se encontraban a cinco puntos de la zona de descenso. Durante su primera temporada, guió al equipo hasta la séptima posición.
Trayectoria como futbolista
Por otro lado, como futbolista estuvo en en la liga de Serbia en el conjunto de Partizán donde debutó antes de migrar a la Liga de España en donde jugó con el Atlético Marbella, Atlético Madrid, RCD Mallorca, Real Oviedo, CD Tenerife, Getafe y UD Almería.
En junio del 2005 llegó al conjunto alemán de Hannover 96 en donde sólo estuvo siete meses. En el 2007 regresó a su país con el Rubin Kazan y Partizán. A pesar de larga trayectoria en equipos, del 2009 al 2011 estuvo inactivo antes de llegar a Philadelphia en la MLS donde solo estuvo una temporada antes de retirarse.
