Nacido en Texas, pero de ascendencia mexicana, Gómez militaba ya en el futbol europeo, específicamente en la Real Sociedad, club de LaLiga en España; no obstante, no pudo asentarse en el conjunto vasco.
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La Real Sociedad optó por transferir al mexicoestadounidense en lo que era su último año de contrato, por lo que así evitó que se marchara como agente libre.
El nuevo contrato de 'JoGo' con el PAOK Salónica es hasta 2028, por lo que el ahora ex de la Real Sociedad tiene confianza y tranquilidad para adaptarse al futbol helénico.
Jonathan Gómez se ha desempeñado en selecciones menores de Estados Unidos, aunque no se descarta que pueda decantarse por la Selección Mexicana de forma definitiva.
En la Super Liga de Grecia se encuentran también los mexicanos Orbelín Pineda y Rodolfo Pizarro, ambos elementos del AEK Atenas.
